En el territorio peninsular existen 32 especies de murciélagos, todas ellas incluidas en el Catálogo Español de Especies Amenazadas, y 24 están presentes en la comunidad andaluza.
Desde 2007, la Consejería de Medio Ambiente realiza el control de 168 refugios de quirópteros cavernícolas, de los más de 2.000 ubicados en la comunidad andaluza.
La selección de los refugios para su seguimiento se realizó según el tamaño de las colonias albergadas, censándose de este modo hasta el 70 por ciento de las poblaciones conocidas.
Debido al elevado número de colonias de cría, el seguimiento regional se completa cada dos años.
Así, de los 168 refugios se censaron 62 en 2010, confirmándose un incremento poblacional en el 25 por ciento de los controlados y registrándose por primera vez crías de murciélago pequeño de herradura.
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